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Kernlokalisierungssignal

Synonyme: Kernlokalisationssignal, Kernkokalisierungssequenz
Englisch: nuclear localization signal

1. Definition

Das Kernlokalisierungssignal, kurz NLS, ist eine Aminosäuresequenz, die signalisiert, dass ein Protein in den Zellkern transportiert werden soll.

siehe auch: Kernexportsignal

2. Hintergrund

Kleinere Moleküle können durch Poren in der Kernmembran diffundieren, während die meisten Proteine aktiv in den Zellkern transportiert werden müssen. Dieser Transport wird durch Importine vermittelt, die das Kernlokalisierungssignal erkennen und die entsprechenden Proteine durch die Poren transportieren. Die Energie für den Transport stammt vom GTP/GDP-Zyklus des kleinen G-Proteins Ran.

3. Aufbau

Das NLS ist eine kurze Signalsequenz, die positiv geladene Aminosäuren enthält, einschließlich Lysin (K) und/oder Arginin (R). Es wird zwischen klassischen und nicht-klassischen NLS unterschieden. Die klassischen NLS gliedern sich weiter in einteilige (engl. "monopartite") und zweiteilige (engl. "bipartite") Signalsequenzen auf. Bei den zweiteiligen liegt ein Spacer-Sequenz von in der Regel 10 bis 12 Aminosäuren zwischen den positiv geladenen Aminosäuren.

Typ Unterteilung Konsensussequenz und Beispiele
klassische NLS einteilig

K(K/R)X(K/R)*

zweiteilig

R/K(X)10-12KRXK

nicht-klassische NLS PY-NLS

(basisch/hydrophob)-Xn-(R/H/K)-(X)2–5-PY

  • PGKMDKGEHRQERRDRPY (EWS)
M9-Domäne

38 Aminosäuren lang, positive Ladung

* X kann für jegliche Aminosäure stehen, die anderen Buchstaben entsprechen dem Einbuchstabencode

4. Vorkommen

NLS kommen bei Proteinen vor, die wichtige Aufgaben im Zellkern erfüllen:

5. Weblinks

6. Quellen

Fachgebiete: Biochemie

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21.03.2024, 09:12
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