Hormonresponsives Element
Synonym: hormonempfindlicher Bereich
Englisch: (hormone) response element, hormone responsive element
Definition
Hormonresponsive Elemente, kurz HRE, sind kurze DNA-Sequenzabschnitte. Sie befinden sich innerhalb der Promoterregion verschiedener Gene und dienen als Bindungsstelle für Kernrezeptoren.
Hintergrund
HREs bestehen i.d.R. aus Wiederholungen von sechs Nukleotiden, sogenannten Hexanukleotid-Repeats. Die Spezifität der Bindungsstelle wird durch die Nukleotidsequenz, die Ausrichtung und den Abstand zwischen den jeweiligen Repeats bestimmt.
Nach Aktivierung durch Hormone oder andere Liganden können Kernrezeptoren über ihre DNA-bindende Domäne (DBD) an die HREs binden. Die meisten Kernrezeptoren binden diese als Homo- oder Heterodimer.
Struktur
Konsensussequenz
Unter anderem sind folgende HRE-Konsensussequenzen der verschiedenen Kernrezeptoren bekannt:
- 5'-AGGTCA-3' für Retinsäurerezeptoren, Retinoid-X-Rezeptoren, Peroxisom-Proliferator-aktivierte Rezeptoren und Vitamin-D-Rezeptoren
- 5'-AGAACA-3' für Glukokortikoidrezeptoren
- 5'-TCAGGTCA-3' für Schilddrüsenhormonrezeptoren
Ausrichtung
Es existieren verschiedene Möglichkeiten, wie die jeweiligen Repeats zueinander ausgerichtet sind:
- direkte Repeats ("direct repeats") (DR): die sich wiederholenden Sequenzen sind identisch
- 5'-AGGTCA.....AGGTCA-3'
- 3'-TCCAGT.....TCCAGT-5'
- invertierte Repeats ("inverted repeats") (IR): die sich wiederholenden Sequenzen sind revers komplementär angeordnet
- 5'-AGGTCA.....TGACCT-3'
- 3'-TCCAGT.....ACTGGA-5'
- evertierte Repeats ("everted repeats") (ER): die sich wiederholenden Sequenzen befinden sich auf gegenüberliegenden DNA-Strängen
- 5'-AGGTCA.....TCCAGT-3'
- 3'-TCCAGT.....AGGTCA-5'