Walker-A-Motiv
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nach dem englischen Molekularbiologen und Chemiker John Ernest Walker
Englisch: Walker A motif, Walker loop, P-loop, phosphate-binding loop
Definition
Das Walker-A-Motiv ist ein Strukturmotiv, das in ATP- und GTP-bindenden Proteinen vorkommt. Dazu zählen u.a. Kinasen, ATP-Synthasen und Ras-Proteine. Auf das Walker-A-Motiv folgt downstream das Walker-B-Motiv.
Struktur
Der Walker-A-Motiv enthält die Konsensussequenz GXXXXGKT/S. "G", "K", "T" und "S" stehen für die Aminosäuren Glycin, Lysin, Threonin und Serin, während "X" eine beliebige Aminosäure bezeichnet. Dieser Abschnitt bildet eine Schleife (engl. loop), der ein β-Strang vorausgeht und auf die eine α-Helix folgt. Die Phosphatgruppe wird über den Lysin-Rest und die Stickstoffgruppen des Hauptstranges gebunden.