Walker-B-Motiv
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nach dem englischen Molekularbiologen und Chemiker John Ernest Walker
Englisch: Walker B motif
Definition
Das Walker-B-Motiv ist ein Strukturmotiv, das in ATP- und GTP-bindenden Proteinen vorkommt. Dazu zählen u.a. Kinasen, ATP-Synthasen und Ras-Proteine. Es liegt downstream des Walker-A-Motivs.
Struktur
Der Walker-B-Motiv enthält die Konsensussequenz hhhhDE. "D" und "E" stehen für die Aminosäuren Asparaginsäure und Glutaminsäure, während "h" eine beliebige hydrophobe Aminosäure bezeichnet. Das Walker-B-Motiv hat eine deutlich höhere Variabilität als das Walker-A-Motiv und ist weniger stark konserviert.
Funktion
Das Walker-B-Motiv spielt eine Rolle bei der ATP-Hydrolyse.