Pyrin-Domäne
Synonyme: DAPIN-Domäne, PAAD-Domäne
Englisch: pyrin domain, DAPIN domain, domain in apoptosis and interferon response
1. Definition
Die Pyrin-Domäne, kurz PYD, ist ein Interaktionsmodul, das zur Death-Fold-Superfamilie zählt und homotypische Interaktionen vermittelt. Es kommt meist in Proteinen vor, die an der Regulation von Apoptose und Pyroptose beteiligt sind.
2. Struktur
Die Pyrin-Domäne befindet sich am N-Terminus und besteht aus sechs a-Helices, die ähnlich dem Greek-Key-Motiv antiparallel angeordnet sind: ↑H1, ↓H4, ↑H3, ↓H2, ↑H5, ↓H6
Im Vergleich zu den anderen Death-Fold-Domänen, haben Pyrin-Domänen die kürzeste H3-Helix. Sie folgt auf eine flexible Schleife (engl. loop) mit variabler Länge.
Die Gesamtlänge des Moduls beträgt in etwa 90 Aminosäuren.
3. Biochemie
Die PYD ist für die homotypische Interaktion mit anderen PYD-beinhaltenden Proteinen verantwortlich.
4. Funktion
PYDs spielen eine Rolle in Pattern-Recognition-Rezeptoren, die DAMPs und PAMPs erkennen. Nach deren Aktivierung wird die PYD durch Konformationsänderung zugänglich und bindet das Adapterprotein ASC. Weitere ASC-Oligomerisierung über PYDs und CARDs ist der initiale Schritt für die Inflammasom-Bildung.
5. Proteine
6. Quellen
- InterPro – DAPIN domain, abgerufen am 29.12.2021