Einzelstrang-bindendes Protein
Synonyme: Einzelstrang-Bindungsprotein, SSB-Protein
Englisch: single strand binding protein
Definition
Einzelstrang-bindende Proteine, kurz SSBs, sind Proteine, die kooperativ an die DNA binden, um die Replikation zu erleichtern.
Funktion
Einzelstrang-bindende Proteine verhindern ein vorzeitiges Re-Annealing der getrennten DNA-Stränge während der Replikation und schützen sie vor dem Abbau durch Nukleasen.
Darüber hinaus verhindern sie die Ausbildung von Sekundärstrukturen. Sie besitzen eine hohe Affinität für einzelsträngige DNA und kommen in hoher Konzentration in der Zelle vor. Dadurch können sie auch bei DNA-Schäden, wie Doppelstrangbrüchen, innerhalb kürzester Zeit binden und die freien Bereiche vor weiterer Degradation schützen.
Struktur
Bakterielle Einzelstrang-bindende Proteine sind meist Tetramere aus vier identischen Untereinheiten von jeweils etwa 19 kDa.
In Eukaryoten wird die Funktion durch das Replication protein A (RPA) ausgeübt. Dieses ist ein Trimer aus drei unterschiedlichen Untereinheiten. Es besitzt keine Sequenzhomologie zu den bakteriellen SSBs. In den Mitochondrien ist ein zusätzliches SSB (mtSSB) lokalisiert, das eine höhere Sequenzhomologie zum bakteriellen SSB hat.