Ribosomale Bindungsstelle
Synonym: Ribosomen-Bindungsstelle
Englisch: ribosome-binding site
Definition
Die ribosomale Bindungsstelle, kurz RBS, ist der Bereich der mRNA, an den das Ribosom im Rahmen der Translationsinitiation bindet.
...bei Prokaryoten
Bei Prokaryoten besteht die RBS aus:
- der Shine-Dalgarno-Sequenz
- dem Startcodon
- den Nukleotiden zwischen Shine-Dalgarno-Sequenz und dem Startcodon
- den 5 bis 6 ersten Codons des offenen Leserahmens
Der Aufbau der RBS bestimmt die Translationsrate.
...bei Eukaryoten
Bei Eukaryoten bindet die kleine ribosomale Untereinheit (40 S) als Bestandteil des Präinitiationskomplexes zunächst an die 5'-Cap-Struktur der mRNA. Diese Bindung wird u.a. durch den eIF4-Komplex vermittelt. Der Präinitiationskomplex scannt die mRNA bis zum ersten Startcodon, wo die Vereinigung mit der großen Untereinheit (60 S) stattfindet.
Neben dem 5'-Cap existieren in einigen mRNAs auch interne ribosomale Eintrittsstellen ("internal ribosome entry sites", IRES). Diese weisen eine spezifische Sekundärstruktur auf, worüber die Bindung des Ribosoms vermittelt wird.