Long interspersed nuclear element
Synonym: long interspersed repetitive element
Definition
Long interspersed nuclear elements, kurz LINEs, sind repetitive, transponierbare DNA-Sequenzen, die zu den Retrotransposons zählen. Sie haben eine Länge von ca. 6.000 bis 8.000 Basenpaaren und kommen in etwa 850.000-facher Kopie im menschlichen Genom vor. Dies entspricht bis zu 20 % des gesamten Genoms.
siehe auch: short interspersed nuclear element (SINE)
Hintergrund
LINEs gehören zu den mobilen DNA-Elementen und besitzen die Fähigkeit, autonom eine Transposition durchzuführen, da sie eine reverse Transkriptase und Endonuklease enthalten. Die Transkription von LINEs erfolgt durch die RNA-Polymerase II.
Die Elemente der LINEs werden als L1-Element bezeichnet. L1-Elemente verfügen über zwei offene Leseraster, die als ORF1 und ORF2 ("open reading frame") bezeichnet werden. Der OFR1 kodiert für ein RNA-bindendes Protein (RBP), ORF2 kodiert für ein bifunktionelles Protein, das sowohl als Endonuklease als auch als reverse Transkriptase fungiert.
Die meisten L1-Elemente wurden nicht vollständig transponiert und besitzen daher oft eine unvollständige 5´-UTR.
Literatur
- Nordheim, Knippers, Molekulare Genetik, 10. Auflage, Thieme Verlag