Vollständige Genomsequenzierung
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Synonym: Gesamtgenomsequenzierung
Englisch: whole genome sequencing, WGS
1. Definition
Die vollständige Genomsequenzierung, kurz WGS, ist ein molekulargenetisches Analyseverfahren zur vollständigen Sequenzierung des Genoms eines Organismus.
siehe auch: vollständige Exomsequenzierung, Genpaneldiagnostik
2. Prinzip
Die WGS beruht auf der Technologie des Next Generation Sequencing und gliedert sich in mehrere Schritte:
- Fragmentation: Zunächst wird die DNA in Fragmente zerlegt, die klein genug sind, um sequenziert zu werden.
- Adaption: Daraufhin werden spezifische Adapter-Oligonukleotide hinzugefügt, die an die DNA-Fragmente binden und so eine DNA-Bibliothek erstellt.
- Sequenzierung: Die markierte DNA wird anschließend sequenziert, um die Basenabfolge (A, T, C, G) zu analysieren und damit den genetischen Code für weitere Analysen in silico verfügbar zu machen.
- Datenanalyse: Die gewonnenen Daten werden bioinformatisch analysiert.
Fachgebiete:
Mikrobiologie, Molekulargenetik