Uridylat-spezifische Endoribonuklease
Englisch: uridylate-specific endoribonuclease, NendoU
Definition
Die Uridylat-spezifische Endoribonuklease, kurz NendoU, ist eine Ribonuklease, die einzel- und doppelsträngige RNA-Ketten an ihren Uridylat-Residuen spaltet. Sie ist ein genetischer Marker von Nidoviren und kommt als Nichtstrukturprotein beim Coronavirus SARS-CoV-2 vor.
Biochemie
NendoU spaltet vorzugsweise doppelsträngige RNA upstream und downstream von Uridylat-Residuen an GUU- oder GU-Sequenzen. Dabei entstehen RNA-Fragmente mit 2'-3'-zyklischen Phosphatenden. 2'-O-Ribose-methylierte RNA ist gegenüber NendoU stabil. Das weist auf eine funktionelle Verbindung zwischen der NendoU und der O-Ribose-Methyltransferase hin, die im Polyprotein-Gen ORF1ab der Coronaviren nebeneinander als NSP15 und NSP16 kodiert sind.[1]
Quellen
- ↑ Ivanov KA et al.: Major genetic marker of nidoviruses encodes a replicative endoribonuclease Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Aug 24; 101(34): 12694–12699. Published online 2004 Aug 10. doi: 10.1073/pnas.0403127101 PMCID: PMC514660 PMID: 15304651