Assemblage (Mikrobiologie)

Der Begriff wird vor allem für die genetische Einteilung von Mikroorganismen verwendet, deren Isolate sich molekulargenetisch unterscheiden, morphologisch jedoch nicht differenzierbar sind. Assemblagen werden in der Regel anhand von Sequenzanalysen mehrerer Genloci definiert und häufig mit Buchstaben (z.B. A, B, C) bezeichnet.

Klinische Bedeutung besitzt der Begriff insbesondere bei Giardia duodenalis. Hier sind bislang acht Assemblagen (A–H) beschrieben. Infektionen des Menschen werden überwiegend durch die Assemblagen A und B verursacht, während die übrigen Assemblagen vorwiegend an bestimmte Tierarten adaptiert sind. Die Bestimmung der Assemblage dient vor allem epidemiologischen Untersuchungen und der Erforschung zoonotischer Übertragungswege; sie gehört nicht zur Routinediagnostik.