Codonverwendung
Englisch: codon usage, codon bias
Definition
Hintergrund
Im genetischen Code gibt es 64 verschiedene Codons: 61 Codons kodieren Aminosäuren, 3 Codons sind Stopcodons. Da der genetische Code nur in 20 Aminosäuren translatiert wird, werden manchen Aminosäuren redundant durch mehrere Codons kodiert. Die Verwendung dieser Codons unterscheidet sich bei verschiedenen Spezies - viele Organismen haben im Laufe der Evolution ihr eigenes Nutzungsmuster entwickelt. Bestimmte Codons werden häufiger verwendet, als dies bei zufälliger Nutzung zu erwarten wäre. Diese Bevorzugung bestimmter Codons bezeichnet man auch als "codon bias".
Die Codonverwendung wird durch die tRNA-Konzentration in einer Zelle gespiegelt. Sie hat einen großen Einfluss auf die Regulation der Proteinbiosynthese. Häufig verwendete Codons beschleunigen die Translation, selten genutzte Codons bremsen sie.