Inverted Repeat
Synonym: umgekehrte Wiederholung
Englisch: inverted repeat
1. Definition
Ein Inverted Repeat, kurz IR, ist eine Nukleotidsequenz auf einem Nukleinsäurestrang, die sich strangabwärts in umgekehrt komplementärer Reihenfolge wiederholt (z.B. 5’-xxx-ATGCA-nnn-TGCAT-xxx-3’). Der zwischen beiden Sequenzen liegende Abschnitt ("nnn") kann eine beliebige Länge haben.
2. Hintergrund
Die komplementären Abschnitte eines Inverted Repeat können Haarnadelstrukturen (Stamm-Schleifen-Struktur) ausbilden. Dabei handelt es sich um kurze Doppelhelices.