Palindrom
Definition
Ein Palindrom ist eine Zeichenfolge, die vorwärts- und rückwärtsgelesen den gleichen Sinn ergibt.
Hintergrund
Der Begriff Palindrom kommt ursprünglich aus dem Bereich der Sprachwissenschaften und bezeichnet Wörter oder Wortreihen, die vorwärts- und rückwärts gelesen werden können. Bekanntes Beispiel ist das Wort "Lagerregal".
In der Genetik spricht man von palindromischen Sequenzen, wenn die Nukleotidreihenfolge auf den beiden komplementären Strängen der DNA jeweils vom 5' zum 3' Ende gelesen identisch ist. Über solche Abschnitte binden häufig Proteine an die Nukleinsäure. Die Erkennungssequenzen für Restriktionsenzyme sind z.B. typischerweise palindromisch.
Beispiel
Die Erkennungssequenz für das Restriktionsenzym EcoRI hat z.B. folgende palindromische Sequenz:
- 5'-GAATTC-3'
- 3'-CTTAAG-5'