Zinkfingerprotein

Englisch: zinc finger

1 Definition

Als Zinkfingerproteine bezeichnet man eine Klasse von Proteinen, die eine sog. Zinkfingerdomäne besitzen. Bei dieser Domäne ist ein Zinkion koordinativ an das Protein gebunden. Die Bindung dieses Zinkions verursacht eine fingerförmige Schleifenbindung der Polypeptidkette. Dieser Zinkfinger kann spezifisch mit DNA und RNA interagieren.

2 Aufbau und Funktion

Alle Zinkfingerproteine haben mindestens eine Zinkfingerdomäne, die sich um ein zentrales Zinkion faltet. Da sie Zinkfinger-Domäne hauptsächlich an DNA bindet, agieren viele Zinkfingerproteine als Transkriptionsfaktoren. Sie spielen aber auch eine Rolle als Rezeptorprotein, so findet sich ein Zink-Finger-Motiv z.B. bei Steroidrezeptoren.

Die Schleife des Proteins kann unterschiedlich ausgeprägt sein. Man unterscheidet daher verschiedene Faltungsformen. Die Zinkfingerdomäne besteht immer aus einer Consensus-Sequenz, die je nach Art der Zinkfingerdomäne variieren kann

• Cys2His2: Zwei Liganden formen einen Achsenschenkel und zwei weitere den C-Terminus einer Helix
• Gag knuckle: Zwei Liganden formen einen Achsenschenkel und zwei weitere eine kurze Helix oder eine Schlinge
• treble clef: Zwei Liganden formen einen Achsenschenkel und zwei weitere bilden den N-Terminus einer Helix
• Zinc ribbon: Zwei Liganden formen jeweils zwei Achsenschenkel
• Zn₂/Cys₆: Zwei Liganden formen den N-Terminus und zwei weitere formen eine Schleife
• TAZ2 domain like: Zwei Liganden formen die Termini von zwei Helices

3 Anwendung

Da Zinkfingerproteine spezifisch an nahezu jede DNA-Sequenz binden können, bieten Sie ein großes Potential in der Gentherapie.