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Uridylat-spezifische Endoribonuklease: Unterschied zwischen den Versionen

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NendoU spaltet vorzugsweise doppelsträngige RNA [[upstream]] und [[downstream]] von Uridylat-Residuen an GUU- oder GU-Sequenzen. Dabei entstehen RNA-Fragmente mit 2'-3'-zyklischen [[Phosphat]]enden. [[O-Ribose-Methyltransferase|2'-O-Ribose-methylierte]] RNA ist gegenüber NendoU stabil. Das weist auf eine funktionelle Verbindung zwischen der NendoU und der O-Ribose-Methyltransferase hin, die im [[Polyprotein]]-Gen ORF1ab der Coronaviren nebeneinander als NSP15 und NSP16 kodiert sind.<ref>Ivanov KA et al.: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC514660 Major genetic marker of nidoviruses encodes a replicative endoribonuclease] Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Aug 24; 101(34): 12694–12699. Published online 2004 Aug 10. doi: 10.1073/pnas.0403127101 PMCID: PMC514660 PMID: 15304651</ref>
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NendoU spaltet vorzugsweise doppelsträngige RNA [[upstream]] und [[downstream]] von Uridylat-Residuen an GUU- oder GU-Sequenzen. Dabei entstehen RNA-Fragmente mit 2'-3'-zyklischen [[Phosphat]]enden. 2'-O-Ribose-methylierte RNA ist gegenüber NendoU stabil. Das weist auf eine funktionelle Verbindung zwischen der NendoU und der [[O-Ribose-Methyltransferase]] hin, die im [[Polyprotein]]-Gen ORF1ab der Coronaviren nebeneinander als NSP15 und NSP16 kodiert sind.<ref>Ivanov KA et al.: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC514660 Major genetic marker of nidoviruses encodes a replicative endoribonuclease] Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Aug 24; 101(34): 12694–12699. Published online 2004 Aug 10. doi: 10.1073/pnas.0403127101 PMCID: PMC514660 PMID: 15304651</ref>
  
 
==Quellen==
 
==Quellen==

Aktuelle Version vom 29. Februar 2020, 12:47 Uhr

Englisch: uridylate-specific endoribonuclease, NendoU

1 Definition

Die Uridylat-spezifische Endoribonuklease, kurz NendoU, ist eine Ribonuklease, die einzel- und doppelsträngige RNA-Ketten an ihren Uridylat-Residuen spaltet. Sie ist ein genetischer Marker von Nidoviren und kommt als Nichtstrukturprotein beim Coronavirus SARS-CoV-2 vor.

2 Biochemie

NendoU spaltet vorzugsweise doppelsträngige RNA upstream und downstream von Uridylat-Residuen an GUU- oder GU-Sequenzen. Dabei entstehen RNA-Fragmente mit 2'-3'-zyklischen Phosphatenden. 2'-O-Ribose-methylierte RNA ist gegenüber NendoU stabil. Das weist auf eine funktionelle Verbindung zwischen der NendoU und der O-Ribose-Methyltransferase hin, die im Polyprotein-Gen ORF1ab der Coronaviren nebeneinander als NSP15 und NSP16 kodiert sind.[1]

3 Quellen

  1. Ivanov KA et al.: Major genetic marker of nidoviruses encodes a replicative endoribonuclease Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Aug 24; 101(34): 12694–12699. Published online 2004 Aug 10. doi: 10.1073/pnas.0403127101 PMCID: PMC514660 PMID: 15304651

Tags:

Fachgebiete: Biochemie

Diese Seite wurde zuletzt am 29. Februar 2020 um 12:47 Uhr bearbeitet.

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