Rho-Faktor

Synonym: ρ-Faktor, Rho
English: Rho-factor, rho termination factor

1 Definition

Der Rho-Faktor ist ein hexameres Protein und agiert als Terminationsfaktor in der prokaryotischen Transkription.

2 Hintergrund

Damit in der Transkription eine RNA mit korrekter Länge entsteht, muss nicht nur der Beginn (Initiation), sondern auch das Ende (Termination) genau definiert sein. Diese Termination muss dazu führen, dass sich die RNA-Polymerase von der DNA löst und die entstandene RNA-Kette freigibt. In Prokaryoten kann dies über eine palindromische Sequenz in der DNA geschehen, welche zu einer terminierenden Haarnadelstruktur in der RNA führt, oder durch den Rho-Faktor. Das wird dann als Rho-abhängige Termination bezeichnet.^[1] In Escherichia coli kommen beide Mechanismen etwas gleichhäufig vor.^[2]

3 Struktur

Rho ist ein ringförmiges Hexamer und besitzt Helikasen-Aktivität. Jedes Monomer besteht aus zwei Domänen. Es existieren zwei mRNA-Bindungsstellen, welche als 1° und 2° Bezeichnet werden. Die N-terminale Domäne enthält die Bindungsstelle 1°, mittels der die initiale Bindung an die RNA vermittelt wird. 2° befindet sich am C-Terminus und ist für die Translokation an der RNA verantwortlich.

4 Eigenschaften

Die Rekrutierung von Rho wird durch die spezifische Sequenz rut vermittelt. Rho bindet während der Transkription direkt an die wachsende RNA und bewegt sich in Richtung der RNA-Polymerase. Diese Translokation geschieht durch Hydrolyse von ATP. Sobald Rho auf die Polymerase trifft, katalysiert es die Trennung der RNA von der DNA durch seine Funktion als Helikase.^[2]

5 Quellen

1. ↑ Klug, W. S. Concepts of genetics. 10th edn, (Pearson Education, 2012).
2. ↑ ^{2,0 2,1} Kaplan, D. L. & O'Donnell, M. Rho factor: transcription termination in four steps. Curr Biol 13, R714-716 (2003).